研究报告

蓖麻 RcGA20ox1 基因克隆及生物信息学分析  

丛安琪1 , 李国瑞1,2,3,4 , 王月5 , 李威5 , 李晓晨5 , 黄凤兰1,2,3,4 , 陈永胜 1,2,3,4
1 内蒙古民族大学生命科学学院, 通辽, 028000; 2 内蒙古自治区高校蓖麻产业工程技术研究中心, 通辽, 028000; 3 内蒙古自治区蓖麻育种重点实验室, 通辽, 028000; 4 内蒙古自治区蓖麻产业协同创新培育中心, 通辽, 028000; 5 内蒙古民族大学农学院, 通辽, 028000
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2018 年, 第 16 卷, 第 4 篇   
收稿日期: 2017年10月12日    接受日期: 2017年11月12日    发表日期: 2018年06月28日
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摘要

GA20 氧化酶是赤霉素生物合成途径中的重要氧化酶,我们尝试克隆该酶,发掘蓖麻中 GA20ox 家族候选基因,并推测其功能。根据 NCBI 上已知蓖麻 GA20ox1 基因(XM_002510827.2)序列设计引物,扩增得到 GA20ox 基因片段,连接 pMD18-T 载体,得到 RcGA20ox1 cDNA 完整的开放阅读框序列 1 137 bp,并对其进行序列比对、转录物理化性质分析、疏水性、功能域分析及其三级结构预测。推测其可编码 378 个氨基酸,为亲水性稳定蛋白;基因隶属 PcbC superfamily 家族,为非分泌蛋白、细胞质蛋白、含有 28 个磷酸化位点;预测结构由 8 - 螺旋和 8 - 折叠构成;与大戟科巴西橡胶树、木薯和麻疯树高度同源。本研究为蓖麻GA 生物合成乃至蓖麻矮化相关研究提供一定的理论与实践依据。

关键词
蓖麻;GA20ox;基因克隆;生物信息学分析

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《分子植物育种》印刷版
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